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  • 国内刊号:CN 32-1115/S
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    中国农业科学院蚕业研究所
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白桑bZIP基因家族的全基因组鉴定及表达谱分析

【期刊年份】2022年第06期
【作者姓名】邓璇  陈春兵  刘练练  邓静  李娟  查幸福
【作者单位】西南大学,家蚕基因组生物学国家重点实验室

摘要  碱性亮氨酸拉链转录因子(bZIP)是真核生物中广泛存在的转录因子,对于植物生长发育的作用意义非凡。通过同源检索在白桑基因组中共鉴定得到50个MabZIP基因,其仅在桑树的12条染色体上分布,且分布不均匀。理化性质分析发现有27个bZIP的等电点小于7.0,表明桑树的bZIP家族成员超过一半为酸性蛋白,亚细胞定位预测50个bZIP蛋白皆位于细胞核。参照拟南芥bZIP分支情况可将桑树的bZIP分为12个亚族,其中A亚族蛋白数目最多。桑树bZIP家族的同一亚族具有相似的外显子数目,不同亚族外显子数目从1~18个不等。组织表达分析表明,桑树bZIP家族大部分基因在根、茎、叶和果实中均有表达,少数基因只在特定组织表达。研究结果为桑树bZIP的克隆及功能研究提供了理论支撑。

关键词  白桑; 碱性亮氨酸拉链转录因子; 全基因组鉴定; 表达谱分析